Спустя много времени после любого конца следует новое начало. Что-то потерянное с незапамятных времен возвращается в наш мир, и две души, такие разные, но всё же невероятно схожие, столкнутся, как и было им предначертано судьбой.

Попав в ловушку в битве с последним Левиафаном, Синдзи Икари оказывается в подозрительно знакомом ему мире. И, пока он вместе с невольным спутником пытается разобраться, что к чему, некто, находящийся за пределами вселенной, готовится пойти на все, чтобы вернуть Синдзи к себе.