Угроза истребления человечества нейтрализована. Альянс празднует победу. Но остатки серафим в галактике всё ещё представляют опасность. Захватчики, оставшись отрезанными от основных сил, стали объединятся в малочисленные группы и совершать нападения на колонии-убежища. В ответ ОФЗ, Кибран и верные принцессе Эон создали смешанные отряды командующих, задачами которых являются поиск и уничтожение рэйдеров, а так же защита атакованных колоний. Но для одного из них это станет началом новой войны.